环球观点:Biome-BGC生态系统模型与Python融合

Biome-BGC是利用站点描述数据、气象数据和植被生理生态参数,模拟日尺度碳、水和氮通量的有效模型,其研究的空间尺度可以从点尺度扩展到陆地生态系统。在Biome-BGC模型中,对于碳的生物量积累,采用光合酶促反应机理模型计算出每天的初级生产力(GPP),将生长呼吸和维持呼吸减去后的产物分配给叶、枝条、干和根。生物体的碳每天都按一定比例以凋落方式进入凋落物碳库;对于水份输运过程,该模型模拟的水循环过程包括降雨、降雪、冠层截留、穿透降水、树干径流、 冠层蒸发、融雪、雪升华、冠层蒸腾、土壤蒸发、蒸散、地表径流和土壤水分变化以及植物对水分的利用;对于土壤过程,模型考虑了凋落物分解进入土壤有机碳库过程、土壤有机物矿化过程和基于木桶模型的水在土层间的输送关系;对于能量平衡,该模型还考虑了净辐射、感热通量和潜热通量等过程。讲授利用中国区域地面气象要素驱动数据集(CMFD)和CN05.1气候数据格点化气象数据驱动Biome-BGC在区域上进行模拟。在模拟过程中,需要综合的使用Linux、Python等一些小工具,完成模式的前处理和后处理的工作。


(资料图片)

一、Biome-BGC模式介绍

二、夯实基础

Linux应用实现批量创建文件、删除文件及文件夹并行化执行程序 

CDO工具应用使用cdo工具对netCDF文件进行合并筛选时间和变量,裁剪为

Python应用Python的循环语句,逻辑语句,创建Numpy数组,并统计计算;使用Matplotlib制作散点图、等值线图;利用零散数据Pandas创建数,制作时间利用Xarray读取netCDF文件,写入netCDF文件;实现插值工作

三、数据处理实践在linux 上综合使用cdo和xarray数据制备所需数据

1静态数据制备地形数据:GTOPO30S 1km 土地利用数据:GLCC 1km土壤数据:FAOGPP数据:MODIS数据

2驱动数据制备CN05.1数据处理CMFD数据处理

3生态数据MODIS GPP

四、单点的模拟原理+实践

1前处理从空间数据(netCDF)插值配置运行文件制备气象数据

2运行BGC模型

3调参基于Python的并行化参数搜索调整生长季开始和结束

结果统计计算结果可视化

五、区域模拟-1

区域模拟是将区域上每个格点分别进行计算进行的模拟前准备分配数据并行运行合并结果

六、区域模拟-2

通过数据库的管理,可以减少单点模型空间化数据分发和管理复杂度MySQL介绍常见命令介绍在Mysql中建立驱动数据、静态数据表和结果表编写脚本自动化生成静态数据并行运行模式结果导入数据库后处理案例数据

七、长时间序列模拟案例实践

使用ERA5作为观测数据的降尺度后的CMIP6未来气候变化降尺度数据。对气象数据降尺度,获得气温、湿度、降水和向下短波辐射。土壤数据、植被数据库查询准备气象数据和静态数据后处理模拟结果数据

关键词: 数据处理 模拟结果

编辑: MO
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